Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXO3O43524 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXO3O43524 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXO3O43524 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXO3O43524 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXO3O43524 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXO3O43524 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXO3O43524 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXO3O43524 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXO3O43524 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXO3O43524 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXO3O43524 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXO3O43524 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXO3O43524 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXO3O43524 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXO3O43524 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXO3O43524 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms