Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FANCAO15360 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FANCAO15360 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FANCAO15360 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FANCAO15360 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FANCAO15360 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FANCAO15360 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FANCAO15360 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FANCAO15360 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FANCAO15360 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FANCAO15360 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
FANCAO15360 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
FANCAO15360 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FANCAO15360 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FANCAO15360 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FANCAO15360 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FANCAO15360 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FANCAO15360 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FANCAO15360 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FANCAO15360 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FANCAO15360 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FANCAO15360 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FANCAO15360 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FANCAO15360 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FANCAO15360 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FANCAO15360 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FANCAO15360 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FANCAO15360 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FANCAO15360 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
FANCAO15360 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FANCAO15360 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FANCAO15360 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FANCAO15360 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FANCAO15360 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FANCAO15360 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FANCAO15360 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FANCAO15360 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FANCAO15360 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FANCAO15360 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FANCAO15360 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FANCAO15360 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FANCAO15360 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FANCAO15360 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FANCAO15360 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FANCAO15360 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FANCAO15360 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
FANCAO15360 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FANCAO15360 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FANCAO15360 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
FANCAO15360 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FANCAO15360 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FANCAO15360 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FANCAO15360 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
FANCAO15360 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
FANCAO15360 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FANCAO15360 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FANCAO15360 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FANCAO15360 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FANCAO15360 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
FANCAO15360 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FANCAO15360 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FANCAO15360 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
FANCAO15360 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FANCAO15360 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FANCAO15360 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FANCAO15360 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FANCAO15360 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
FANCAO15360 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FANCAO15360 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FANCAO15360 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FANCAO15360 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FANCAO15360 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FANCAO15360 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FANCAO15360 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FANCAO15360 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FANCAO15360 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FANCAO15360 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
FANCAO15360 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FANCAO15360 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FANCAO15360 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
FANCAO15360 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FANCAO15360 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FANCAO15360 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
FANCAO15360 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FANCAO15360 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FANCAO15360 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
FANCAO15360 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FANCAO15360 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FANCAO15360 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FANCAO15360 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FANCAO15360 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FANCAO15360 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FANCAO15360 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
FANCAO15360 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FANCAO15360 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FANCAO15360 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FANCAO15360 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FANCAO15360 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FANCAO15360 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
FANCAO15360 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms