Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms