Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CASKO14936 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASKO14936 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASKO14936 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CASKO14936 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASKO14936 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASKO14936 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASKO14936 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CASKO14936 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASKO14936 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASKO14936 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASKO14936 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASKO14936 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASKO14936 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASKO14936 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASKO14936 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASKO14936 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASKO14936 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASKO14936 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASKO14936 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASKO14936 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASKO14936 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASKO14936 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASKO14936 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASKO14936 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASKO14936 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASKO14936 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASKO14936 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASKO14936 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASKO14936 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASKO14936 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASKO14936 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASKO14936 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CASKO14936 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASKO14936 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASKO14936 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASKO14936 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASKO14936 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASKO14936 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASKO14936 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASKO14936 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASKO14936 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASKO14936 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASKO14936 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASKO14936 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASKO14936 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASKO14936 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASKO14936 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASKO14936 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASKO14936 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASKO14936 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASKO14936 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASKO14936 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASKO14936 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASKO14936 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASKO14936 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASKO14936 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASKO14936 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASKO14936 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASKO14936 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASKO14936 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASKO14936 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASKO14936 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASKO14936 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASKO14936 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CASKO14936 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASKO14936 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASKO14936 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASKO14936 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASKO14936 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASKO14936 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASKO14936 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASKO14936 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASKO14936 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASKO14936 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASKO14936 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASKO14936 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASKO14936 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASKO14936 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASKO14936 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CASKO14936 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASKO14936 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASKO14936 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASKO14936 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASKO14936 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CASKO14936 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASKO14936 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CASKO14936 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASKO14936 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASKO14936 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASKO14936 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASKO14936 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASKO14936 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASKO14936 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASKO14936 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASKO14936 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASKO14936 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASKO14936 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASKO14936 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASKO14936 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms