Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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