Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERVV-2B6SEH9 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms