Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms