Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF879B4DU55 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms