Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SRRM5B3KS81 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms