Protein–RNA interactions for Protein: A8MTJ6

FOXI3, Forkhead box protein I3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI3A8MTJ6 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FOXI3A8MTJ6 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXI3A8MTJ6 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXI3A8MTJ6 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXI3A8MTJ6 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXI3A8MTJ6 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXI3A8MTJ6 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXI3A8MTJ6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXI3A8MTJ6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXI3A8MTJ6 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXI3A8MTJ6 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXI3A8MTJ6 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXI3A8MTJ6 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXI3A8MTJ6 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXI3A8MTJ6 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXI3A8MTJ6 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXI3A8MTJ6 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXI3A8MTJ6 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXI3A8MTJ6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXI3A8MTJ6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXI3A8MTJ6 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXI3A8MTJ6 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXI3A8MTJ6 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXI3A8MTJ6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXI3A8MTJ6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXI3A8MTJ6 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms