Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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