Protein–RNA interactions for Protein: A6NKG5

RTL1, Retrotransposon-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL1A6NKG5 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTL1A6NKG5 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTL1A6NKG5 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms