Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms