Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC162PA2VCL2 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms