Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y608

LRRFIP2, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP2Q9Y608 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRFIP2Q9Y608 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms