Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SNX8Q9Y5X2 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms