Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP16Q9Y5T5 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms