Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRPRBQ9Y5M8 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms