Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SH3BP1Q9Y3L3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SH3BP1Q9Y3L3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SH3BP1Q9Y3L3 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SH3BP1Q9Y3L3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SH3BP1Q9Y3L3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SH3BP1Q9Y3L3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms