Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U8

LEMD3, Inner nuclear membrane protein Man1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD3Q9Y2U8 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LEMD3Q9Y2U8 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LEMD3Q9Y2U8 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LEMD3Q9Y2U8 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LEMD3Q9Y2U8 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LEMD3Q9Y2U8 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LEMD3Q9Y2U8 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LEMD3Q9Y2U8 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LEMD3Q9Y2U8 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LEMD3Q9Y2U8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LEMD3Q9Y2U8 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LEMD3Q9Y2U8 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LEMD3Q9Y2U8 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LEMD3Q9Y2U8 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LEMD3Q9Y2U8 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LEMD3Q9Y2U8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LEMD3Q9Y2U8 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LEMD3Q9Y2U8 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LEMD3Q9Y2U8 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LEMD3Q9Y2U8 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LEMD3Q9Y2U8 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LEMD3Q9Y2U8 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LEMD3Q9Y2U8 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LEMD3Q9Y2U8 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LEMD3Q9Y2U8 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LEMD3Q9Y2U8 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LEMD3Q9Y2U8 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LEMD3Q9Y2U8 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LEMD3Q9Y2U8 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LEMD3Q9Y2U8 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms