Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAN1Q9Y2M0 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms