Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVW-1Q9UQF0 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms