Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SMC3Q9UQE7 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms