Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IGSF9BQ9UPX0 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IGSF9BQ9UPX0 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms