Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms