Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNX7Q9UNH6 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms