Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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