Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms