Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FBXO4Q9UKT5 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms