Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIMS3Q9UJD0 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms