Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIG8

SLCO3A1, Solute carrier organic anion transporter family member 3A1, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO3A1Q9UIG8 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO3A1Q9UIG8 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO3A1Q9UIG8 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO3A1Q9UIG8 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO3A1Q9UIG8 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO3A1Q9UIG8 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO3A1Q9UIG8 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO3A1Q9UIG8 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms