Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN11AQ9UI33 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms