Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTSFQ9UBX1 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms