Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms