Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL42Q9P2K6 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms