Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNRD1Q9P1U0 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms