Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMP5Q9NZZ3 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHMP5Q9NZZ3 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms