Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms