Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKIRAS2Q9NYR9 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms