Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
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FAM53CQ9NYF3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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