Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CWC25Q9NXE8 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms