Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM4

TMEM106B, Transmembrane protein 106B, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106BQ9NUM4 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM106BQ9NUM4 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms