Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC39A9Q9NUM3 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC39A9Q9NUM3 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC39A9Q9NUM3 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC39A9Q9NUM3 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC39A9Q9NUM3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC39A9Q9NUM3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC39A9Q9NUM3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC39A9Q9NUM3 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC39A9Q9NUM3 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC39A9Q9NUM3 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC39A9Q9NUM3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC39A9Q9NUM3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC39A9Q9NUM3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC39A9Q9NUM3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC39A9Q9NUM3 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC39A9Q9NUM3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC39A9Q9NUM3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC39A9Q9NUM3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC39A9Q9NUM3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC39A9Q9NUM3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC39A9Q9NUM3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC39A9Q9NUM3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC39A9Q9NUM3 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC39A9Q9NUM3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC39A9Q9NUM3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC39A9Q9NUM3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC39A9Q9NUM3 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC39A9Q9NUM3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC39A9Q9NUM3 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC39A9Q9NUM3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC39A9Q9NUM3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC39A9Q9NUM3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC39A9Q9NUM3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC39A9Q9NUM3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC39A9Q9NUM3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC39A9Q9NUM3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC39A9Q9NUM3 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SLC39A9Q9NUM3 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms