Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GJB4Q9NTQ9 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms