Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABCC13Q9NSE7 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ABCC13Q9NSE7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms