Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSU72Q9NP77 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms