Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZCCHC17Q9NP64 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms