Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AMBRA1Q9C0C7 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AMBRA1Q9C0C7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AMBRA1Q9C0C7 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AMBRA1Q9C0C7 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AMBRA1Q9C0C7 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AMBRA1Q9C0C7 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AMBRA1Q9C0C7 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
AMBRA1Q9C0C7 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AMBRA1Q9C0C7 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AMBRA1Q9C0C7 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AMBRA1Q9C0C7 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AMBRA1Q9C0C7 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AMBRA1Q9C0C7 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AMBRA1Q9C0C7 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AMBRA1Q9C0C7 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AMBRA1Q9C0C7 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AMBRA1Q9C0C7 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AMBRA1Q9C0C7 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AMBRA1Q9C0C7 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AMBRA1Q9C0C7 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AMBRA1Q9C0C7 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AMBRA1Q9C0C7 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
AMBRA1Q9C0C7 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AMBRA1Q9C0C7 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AMBRA1Q9C0C7 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AMBRA1Q9C0C7 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AMBRA1Q9C0C7 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AMBRA1Q9C0C7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AMBRA1Q9C0C7 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AMBRA1Q9C0C7 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AMBRA1Q9C0C7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AMBRA1Q9C0C7 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AMBRA1Q9C0C7 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AMBRA1Q9C0C7 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AMBRA1Q9C0C7 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AMBRA1Q9C0C7 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AMBRA1Q9C0C7 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
AMBRA1Q9C0C7 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AMBRA1Q9C0C7 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AMBRA1Q9C0C7 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AMBRA1Q9C0C7 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AMBRA1Q9C0C7 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
AMBRA1Q9C0C7 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AMBRA1Q9C0C7 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AMBRA1Q9C0C7 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AMBRA1Q9C0C7 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AMBRA1Q9C0C7 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AMBRA1Q9C0C7 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AMBRA1Q9C0C7 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AMBRA1Q9C0C7 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AMBRA1Q9C0C7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AMBRA1Q9C0C7 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AMBRA1Q9C0C7 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AMBRA1Q9C0C7 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AMBRA1Q9C0C7 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AMBRA1Q9C0C7 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AMBRA1Q9C0C7 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AMBRA1Q9C0C7 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms