Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTNAP4Q9C0A0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms