Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms